מטרת החוקרים הייתה להעריך את התפקידים וההטרוגניות של אאוזינופילים ברקמת פוליפ באף (nasal polyp - NP), באמצעות אנליזה של רצף RNA של תא בודד (scRNA-Seq) של רקמת NP.
עוד בעניין דומה
דלקת כרונית בסינוסים עם פוליפים באף (Chronic rhinosinusitis with nasal polyps - CRSwNP) מאופיינת כדלקת מסוג 2 בארצות הברית, אך התפקידים האמיתיים שממלאים אאוזינופילים ב-CRSwNP נותרו ברובם לא ברורים.
רקמות סינונזאליות (NP ורקמת סינוס ששימשה כביקורת) ודגימות דם היקפי (peripheral blood - PB) תואמות למטופל התקבלו מ-5 חולי ביקורת ו-5 חולים עם CRSwNP. אאוזינופילים הועשרו לפני עיבוד ב- scRNA-Seq. פרופילי ביטוי הגנים באאוזינופילים נקבעו על ידי טכנולוגיית scRNA-Seq מבוססת microwell (פלטפורמת BD Rhapsody). החוקרים חזו את התפקוד הכולל של אאוזינופילים מרקמת NP על ידי העשרה של Gene Ontologyי(geneontology.org), ניתוחי מסלול ואישור ביטוי של גנים נבחרים על ידי ציטומטריית זרימה.
תוצאות המחקר הדגימו שלאחר סינון תאים מזהמים, זוהו 5,542 אאוזינופילים מ-PB ששימש כביקורת, 3,883 אאוזינופילים מ-CRSwNP PB,י101 אאוזינופילים מרקמות ביקורת של סינוס (לא הוכללו בניתוחים נוספים), ו-9,727 אאוזינופילים מ-NPqs על ידי scRNA-Seq. נמצא כי רמתם של 204 גנים הוגברה ורמתם של 354 גנים ירדה באאוזינופילים מ-NP בהשוואה לכל האאוזינופילים של PB (פי יותר מ-1.5, Padj <.05). גנים שהוגברו באאוזינופילים של NP היו קשורים להפעלה, איתות בתיווך ציטוקינים, פעילות גורמי גדילה, איתות NF-KB ומולקולות אנטי-אפופטוטיות. אאוזינופילים של NP הציגו 4 אשכולות שחשפו הטרוגניות פוטנציאלית של אאוזינופילים ברקמת NP.
החוקרים הסיקו כי נראה שקיימים אאוזינופילים מוגברים ברקמת NP במספר תת-סוגים שעשויים למלא תפקידים פתוגניים חשובים ב-CRSwNP, בין השאר על ידי שליטה בדלקת וגדילה של תאים אחרים.
מקור:
הירשמו לקבלת עדכונים בנושאים שעלו בכתבה
